Génétique et Épigénétique des Champignons

Introduction

L’équipe GEC est constituée d’enseignants-chercheurs et est donc engagée dans la découverte de nouvelles connaissances ainsi que dans leur diffusion via un enseignement classique ou directement sur internet.

Domaines d’expertises : Mycologie, Génétique et épigénétique, Régulation/différentiation, énergie, Déconstruction de la biomasse.

Responsable d'équipe

Professeur

Equipe actuelle

Maître de conférence

Ingénieur de recherche

Ingénieur d'études

Adjoint technique

  • JAMET-VIERNY Corinne, maître de conférences (1997-2004)
  • MALAGNAC Fabienne, maître de conférences Univ. P7 Denis Diderot, Habilitée à Diriger les Recherches (2002-2014)
  • LALUCQUE Hervé, maître de conférences Univ. P7 Denis Diderot (2007-2015)
  • CHAPELAND-LECLERC Florence, maître de conférences Univ. P5 René Descartes, Habilitée à Diriger les Recherches (2009-2015)
  • RUPRICH-ROBERT Gwenaël, maître de conférences Univ. P5 René Descartes (2009-2015)
  • BRUN Sylvain, maître de conférences Univ. P7 Denis Diderot (2007-2021)
  • ROSSIGNOL Michèle, IE CNRS (1994-1999)
  • HAEDENS Vicki, IE CNRS (1997-2004)
  • FRANCOIS Sylvie, ADT (2006-2013)
  • DAUGET Jean-Marc, IE Univ. paris 7 (2015-2019)
  • CANGEMI Sylvie, AGT (20014-2022)
  • GAGNY Bénédicte, doctorante (1994-1998)
  • LALUCQUE Hervé, doctorant (1998-2002)
  • KICKA Sébastien, doctorant (2001-2005)
  • GOARIN Anne, doctorante (2008-2011)
  • GROGNET Pierre, doctorant (2010-2013)
  • XIE Ning, doctorant Univ. P7 Denis Diderot + postdoc (2010-2014)
  • TANGTHIRASUNUN Narumon, doctorante (2011-2014) et Postdoctorante Ambassade de France Bangkok
  • NGUYEN Tinh-Suong, Doctorante (2015-2018)
  • DEMOOR Alexander, Doctorant Univ. Paris 7 (2017-2021)
  • BROZZATTI Lorenzo, Thèse d’exercice Erasmus (2014)
  • GANESAN Latha Prabha, postdoctorant (2000-2001)
  • SOBERING Andrew K, postdoctorant (2002)
  • GRISSA Ibtissem, postdoc ATER Univ. P7 Denis Diderot (2009-2010)
  • DILMAGHANI Azita, postdoc (2011-2012)
  • TIMPANO Hélène, postdoc ATER Univ. Paris 11 (2012-2014)
  • CHAN HO TONG Laetitia, IE ANR (2012-2014)
  • BOUILLON Julien, Stagiaire MASTER 2 et IE CDD
  • BOUCHER Charlie, AI CDD
  • FOLICHON Marc, étudiant maîtrise (1998-1999)
  • PARDIEU Claire, étudiante DEA de Microbiologie (2000)
  • LEPERE Gersende, étudiante DEA de Génétique 1er stage (2002)
  • KLAPHOLZ Benjamin, étudiant DEA de Génétique 1er stage (2003)
  • MARCHAIS Antonin, étudiant DEA de Génétique 2ème stage (2004)
  • KHALILI Hamid, étudiant DESS de Génomique Fonctionnelle (2004)
  • LIU Jin, Stagiaire MASTER 2
  • POIDEVIN Laetitia, Stagiaire MASTER 2
  • GIRODET Charlène, Stagiaire MASTER 2
  • DELAITRE François, Stagiaire MASTER 2
  • IVANOFF Dimitri, Stagiaire MASTER 2
  • FOREST Thomas, Stagiaire MASTER 2
  • GRAZIANI Stéphane, doctorant Univ. P11 Sud
  • MARTINS Marta, doctorante Univ. P7 Denis Diderot
  • NARUZAWA Erika, doctorante Université Laval (Québec)
  • LACAZE Isabelle, doctorante Univ. P7 Denis Diderot/CSTB
  • BERNIER Louis, Professeur Université Laval, (Québec)
  • LEVERT Emilie, IE

Ressources scientifiques

Page web de Podospora anserina
A venir prochainement
Base de données taxonomiques sur les Sordariales

base de données en cours d’élaboration : pour avoir un aperçu, se connecter avec l’identifiant/mot de passe “guest”/”guest”.

Diffusion des connaissances

Nouveau et gratuit

  • le livre de Génétique (ISBN 978-2-9555841-3-2), en version PDF gratuite
    Génétique

    et toujours disponibles gratuitement

  • Le livre sur Podospora anserina (ISBN 978-2-9555841-2-5), en version PDF gratuite
    Podospora anserina

  • Le livre sur les Bases Fondamentales de la Biologie (ISBN 978-2-9555841-1-8), en version PDF gratuite
    Bases Fondamentales de la Biologie

  • Le livre de Microbiologie eucaryote (ISBN 978-2-9555841-0-1), en version PDF gratuite
    Microbiologie eucaryote

 

Liens de téléchargements des cours pour les étudiants de l’Université de Paris

Thèmes de recherche

Initialement centrées sur des phénomènes de dégénérescences cellulaires, nos recherches ont débouché sur une meilleure compréhension de divers aspects de la biologie des champignons. Nous avons opté pour effectuer nos expériences sur un organisme “modèle” – le champignon filamenteux Podospora anserina – car celui-ci est très facile à étudier au laboratoire: la durée de son cycle est d’une semaine, il se cultive sur des milieux simples et il est possible de l’analyser génétiquement et moléculairement. En particulier, il est facile de sélectionner ou fabriquer des mutants de cet organisme. Actuellement, nous augmentons le nombre d’espèces de champignons sur lesquelles nous effectuons nos travaux, en nous concentrant sur des espèces proches de P. anserina appartenant à l’ordre des Sordariales.

Comme la majorité des champignons, P. anserina a un cycle qui fait alterner une forme mycélienne et une forme sporale:

  • La forme mycélienne est la forme trophique. Elle possède les caractéristiques classiques des mycéliums de Pezizomycotina: extension apicale, septation et anastomoses pour former un syncytium. Néanmoins, au cours de sa croissance mycélienne, P. anserina présente spécifiquement au moins deux processus rapides de vieillissement cellulaire: la Sénescence étudiée depuis maintenant plus de 70 ans et Crippled Growth que nous avons découvert au laboratoire. Ces deux dégénérescences sont sous le contrôle d’éléments génétiques non conventionnels qui sont des “déterminants cytoplasmiques et infectieux”. De tels éléments sont très répandus chez les champignons et ne sont pas des éléments génétiques classiques (plasmides, virus…) mais plutôt des éléments épigénétiques responsables d’instabilités phénotypiques. De plus, dans la nature, le mycélium de P. anserina croit sur des excréments d’herbivore, un milieu envahi par de nombreuses autres espèces fongiques. Nous avons montré que le mycélium de P. anserina présente un mécanisme de défense contre les compétiteurs éventuels appelé Interférence Hyphale.

  • La forme sporale est obtenue uniquement après méïose sous forme d’ascospores, qui servent à la dissémination du champignon. Ces ascospores sont produites dans des structures pluricellulaires différentiées (les périthèces) au cours de la reproduction sexuée. Le développement des périthèces est contrôlé par de nombreux facteurs incluant la carence et la lumière. Une fois produites les ascospores sont éjectées de manière active à l’extérieur du perithèces. Elles ne germent pas spontanément mais nécessitent un stimulus (passage à travers le tube digestif d’un herbivore) que l’on recrée facilement au laboratoire.

Notre but est de comprendre comment les différentes étapes du cycle de P. anserina sont régulées. Nous étudions plus particulièrement le rôle des voies MAP kinases et des NADPH oxydases de P. anserina car elles interviennent à différents niveaux du cycle, incluant Crippled Growth, la reproduction sexuée, l’Interférence Hyphale et la différenciation de structures mises en place par le champignon pour pénétrer la biomasse végétale. Nous avons aussi montré que ces voies régulent la dégradation de la biomasse végétale et notre activité s’oriente aussi vers le décryptage des mécanismes moléculaires de dégradation de la biomasse, principalement celle de la lignine. Enfin, nous participons à des programmes qui visent à mieux comprendre l’évolution des Sordariales et plus particulièrement celle de leurs génomes.

Pour en savoir plus consultez nos publications !!!

Enseignements de Microbiologie Eucaryote et de Mycologie

Une des spécificités de l’équipe GEC est sa participation importante dans des enseignements de microbiologie eucaryotes au niveau L et M et plus spécifiquement de mycologie en L2/L3 et M2. Pour le niveau M, les enseignements sont dispensés au sein du Master de Biologie Moléculaire et Cellulaire en UE obligatoire dans le cadre du parcours de Microbiologie de M1 et en UE optionnelle pour les autres parcours sur l’Origine, diversité et Biologie des Microorganismes Eucaryotes; pour le M2, il s’agit d’un parcours spécifique de Mycologie Environnementale et Médicale intégré au parcours plus général de Microbiologie avec lequel il partage des enseignements. Pour en savoir plus sur le parcours de Microbiologie du Master BMC cliquez ici.

Présentation de l’UE de M1 Origine, diversité et Biologie des Microorganismes Eucaryotes

resp. Philippe Silar – 6 ects

Progamme des cours:

  • Cours de M. Silar (15h)

    • Origine de la cellule eucaryote
    • Grands évènements jalonnant l’évolution des eucaryotes
    • Diversité du monde eucaryote: La nouvelle classification phylogénétique des eucaryotes
    • Rôles des protistes eucaryotes dans la biosphère: Les biotopes à l’échelle des microbes eucaryotes, Cycle global du carbone, Cycle de l’azote et autres cycles géochimiques
    • Interactions des protistes avec les sociétés humaines : Rôles dans l’alimentation, Rôle dans l’industrie pharmaceutique : les métabolites secondaires, Les parasites de l’homme et de ses animaux commensaux, Les parasites des plantes et des autres eucaryotes
  • Cours de M. Brun (10h)

    • Un exemple de cellule eucaryote, Saccharomyces cerevisiae
    • Biologie, Culture et Nutrition
    • Synthèse et Structure des Macromolécules
    • Insertion des Macromolécules dans la Physiologie Cellulaire
    • Cycle et Division Cellulaire
    • La Phase Stationnaire et autres conditions physiologiques
    • La Reproduction Sexuée
    • Utilisation de la Levure par l’Homme
  • Cours de M. Lalucque (10h)

    • Un exemple d’analyse d’un phénomène biologique utilisant un modèle de microbe eucaryote : le phénomène PSI chez la levure Saccharomyces cerevisiae
    • Méthodes génétiques, génomiques, biochimiques et cytologiques
  • TD: présentations de groupes phylogénétiques par les étudiants et corrections d’annales

Contrôle des connaissance: présentation orale de TD = CC 30% de la note + examen final : 70%

Présentation du parcours de Mycologie Environnementale et Médicale

resp. Philippe Silar

Le parcours est un des trois parcours du M2 de microbiologie du Master BMC de l’Université de Paris. Pour en savoir plus sur le M2 de Microbiologie cliquez ici.

2 UE sont spécifiques au parcours :

I- UE Outils modernes d’analyse de la biodiversité fongique – 6 ects

  • A – Acquisition de notions approfondies de la biologie, de la diversité et de la classification des champignons

    Programme du cours 2022-2023

    • Généralités, Styles de vie fongique (P. Silar, LIED)
    • Diversité, phylogénie et classification (P. Silar, LIED)
    • Programmes de développement (P. Silar, LIED)
    • Evolution des génomes fongiques (P. Silar, LIED)
    • L’exemple des Sordariales (P. Silar, LIED)
  • B – Biodiversité des Microorganismes Eucaryotes – Acquisition des méthodes pour étudier les Big Data (génomique, transcriptomique, métagénomique) pertinents aux champignons

    • Notions de bioinformatiques, phylogénie et constructions d’arbres phylogénétiques : 2 TD de 2.5 h (Christophe Lalanne)
    • Première approches de génomiques: assemblage de génome, de transcriptomes et analyses quantitives de transcriptomes (atelier pratique d’une semaine: Christophe Lalanne & Philippe Silar)

II- UE en partenariat avec Sorbonne Université:BIOLOGIE MOLECULAIRE ET CELLULAIRE DES AGENTS INFECTIEUX ET DE LA CELLULE HOTE – 12 ects

équipe pédagogique: Christophe Hennequin, Olivier Silvie & Valérie Soulard – Code de l’UE : 5V641

a) Objectifs de l’Unité d’Enseignement Ce module est le premier module du parcours de M2 Parasitologie/Mycologie fondamentale et médicale de Sorbonne Université . Son objectif est la formation des personnes qui auront en charge la lutte contre les maladies parasitaires et fongiques, qu’elles soient humaines ou animales. Cette formation passe par une meilleure connaissance, au niveau cellulaire et moléculaire, du parasite, du phénomène parasitaire et des interactions hôte-parasite. Les outils de la biologie cellulaire et de la biologie moléculaire ont permis dernièrement des avancées remarquables dans la connaissance des agents et processus parasitaires. Ce savoir est la base indispensable aux parasitologues, qu’ils soient fondamentalistes ou plus impliqués dans une démarche clinique, diagnostique, thérapeutique ou encore dans des actions de valorisation. Il leur permettra de mieux appréhender la physiopathologie des maladies parasitaires et fongiques et d’aborder sur une base rationnelle les stratégies vaccinales et thérapeutiques. Le module s’achève par un exposé des étudiants (validation du module sous forme d’une analyse critique de projets et/ou d’articles scientifiques).

b) Thèmes abordés
Evolution, phylogénie, relation génotypes/phénotypes, diversité etc. application aux parasites

Parasites et Champignons: génome, banque de données, expression génique, transcriptome, protéome, analyse bio-informatique Etude de la variation antigénique, systèmes d’échappement

Régulation de la transcription et ARN interférence dans l’analyse de la biologie cellulaire de protozoaires parasites

Physiopathologie des infections fongiques

Mobilité de protozoaires parasites et processus pathogène

Molécules de surface et mécanismes de transport

Mécanismes d’action de molécules antiparasitaires et résistances

Quelques témoignages d’anciens étudiants du M2:

  • AM (2015) thèse à l’INRA présentée en 2019 – intègre une startup en 2019

    Le Master IMVI m’a permis de développer tout un panel de compétence adapté à mes centres d’intérêts scientifiques. La première année aborde des disciplines générales autours de la microbiologie sous forme de cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques. J’ai été formé en bactériologie, génétique/génomique, biologie moléculaire et bioinformatique et c’est ensuite en M2 que j’ai pu choisir un parcours axé vers la mycologie environnementale et médicale. Les six mois de stage en fin de parcours m’ont permis de travailler dans un laboratoire de recherche en pathologie fongique végétale, où je fais finalement ma thèse. Les cours du M2 ont surtout lieu sous forme de séminaires et d’interventions, et la notation de l’année se fait principalement sur des écrits de type rapport bibliographique, exposés scientifiques… Quelque chose qui se rapproche finalement des compétences régulièrement sollicitées chez un jeune chercheur. Je garde un excellent souvenir de cette formation.

  • AD (2016) en thèse

    Après l’obtention d’une licence en Sciences pour la Santé à l’Université Paris Descartes, j’ai souhaité approfondir mes connaissances en microbiologie afin de réaliser une thèse dans ce domaine. Le master IMVI est une très bonne formation dispensée par des enseignants-chercheurs compétents qui m’ont accompagné jusqu’à l’obtention de ma bourse de thèse. Le M1 m’a fourni des bases théoriques dans les divers domaines de la biologie afin d’avoir une formation aussi complète que possible de manière à nous préparer au mieux à pouvoir faire face aux différents aspects d’un projet de recherche. Le M1 IMVI m’a aussi donné une vue d’ensemble de la microbiologie de façon à choisir au mieux ma spécialisation en M2 en mycologie environnementale et médicale. Le M2 s’inscrit dans la continuité du M1 en nous fournissant une formation théorique et surtout pratique de très bon niveau dans le domaine choisi.

  • CL (2016) attaché scientifique en industrie pharmaceutique en CDI

    Après l’obtention d’une licence en Sciences pour la Santé à l’Université Paris Descartes, j’ai suivi le Master IMVI en me spécialisant en Microbiologie, pour ensuite faire le M2 Microbiologie-Mycologie environnementale et médicale. J’ai beaucoup appris lors de mon parcours, grâce à cette formation, que j’ai trouvé très complète. J’ai été très suivie pendant ces deux années de Master grâce aux enseignants qui ont à cœur la réussite de leurs étudiants. Même si la formation est axée principalement vers la recherche, elle m’a permise d’acquérir des compétences diversifiées et une réelle expérience qui sont des atouts importants aussi recherchés en entreprise tels que la capacité à réfléchir à des problèmes complexes et la capacité d’adaptation… J’ai décidé de ne pas poursuivre une thèse et j’ai été embauchée en CDI en tant qu’attachée scientifique en information médicale en industrie pharmaceutique.

Publications

Dans les revues à comité de lecture

2023

98- Vittorelli N., Rodríguez de la Vega R.C., Snirc A., Levert E., Gautier V., Lalanne C., De Filippo E., Gladieux P., Guillou S., Zhang Y., Tejomurthula S., Grigoriev I.V., Debuchy R., Silar P., Giraud T. & Hartmann F.E. (2023) Stepwise recombination suppression around the mating-type locus in an ascomycete fungus with self-fertile spores. PLOS Genet. 19(2):e1010347.

97- Demoor A., Lacaze I., Ferrari R., Lalanne C., Silar P. & Brun S. (2023) The GUN mutants: new weapons to unravel ascospore germination regulation in the model fungus Podospora anserinaMicrob. Spectr. 11(2):e0146122. doi: 10.1128/spectrum.01461-22..

2022

96- Nguyen T.S., Gautier V., Chan Ho Tong L. & Silar P. (2022) A gene cluster with positive and negative elements controls bistability and hysteresis of the Crippled versus Normal growth in the fungus Podospora anserinaFung. Fenet. Biol. 161: 103711.

2021

95- Gautier V., Levert E., Giraud T. & Silar P. (2021) Important role of melanin for fertility in the fungus Podospora anserinaG3 11(8), jkab159.

94- Vogan A., Miller A.N. & Silar P. (2021) Proposal to change the conserved type of Podospora, nom. cons. (Ascomycota). Taxon 70(2): 429-430.

93- Hartmann F.E., Ament-Velásquez S.L., Vogan A.A., Gautier V., Le Prieur S., Berramdane M., Snirc A., Johannesson H., Grognet P, Malagnac F., Silar P. & Giraud T. (2021) Size variation of the non-recombining region on the mating-type chromosomes in the fungal Podospora anserina species complex. Mol. Biol. Evol. 38(6):2475-2492.

92- Valette N., Renou J., Boutilliat A., Fernández‐González A.J., Gautier V., Silar P., Guyeux C., Charr J.-C., Cuenot S., Rose C., Gelhaye E. & Morel‐Rouhier M. (2021) OSIP1 is a self‐assembling DUF3129 protein required to protect fungal cells from toxins and stressors. Env. Microbiol. 23(3):1594-1607.

91- Hartmann F.E., Duhamel M., Carpentier F, Hood M.E., Foulongne-Oriol M., Silar P., Malagnac F., Grognet P. & Giraud T (2021) Pervasive recombination suppression around mating-type loci in fungi: documenting patterns and understanding evolutionary and proximal causes. New Phytologist 229 (5): 2470-2491.

2020

90- Dicko M., Ferrari R., Tangthirasunun N., Gautier V., Lalanne C., Lamari F. & Silar P. (2020) Lignin degradation and its use in signaling development by the coprophilous ascomycete Podospora anserinaJournal of Fungi 6:278.

89- Lorena Ament-Velásquez S., Johannesson H, Giraud T., Debuchy R., Saupe S.J., Debets A.J.M., Bastiaans E., Malagnac F., Grognet P., Peraza-Reyes L., Gladieux P., Kruys Å., Silar P, Huhndorf S.M., Miller A. & Vogan A. (2020) The taxonomy of the model filamentous fungus Podospora anserinaMycoKeys 75:51-69.

2019

88- Mercier A, Clairet C., Debuchy R, Morais D. Silar P & Brun S (2019) The mitochondrial translocase of the inner membrane PaTim54 is involved in defense response and longevity in Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 132: 1032572.

87- Demoor A, Silar P & Brun S (2019) Appressorium: The Breakthrough in Dikarya. J. Fungi 5(3): 72.

86- Silar P, Dauget JM, Gautier V, Grognet P, Chablat M, Hermann Le Denmat S, Couloux A, Wincker P & Debuchy R (2019) A gene graveyard in the genome of the fungus Podospora comataMol. Gen. Genom. 294: 177-190.

2018

85- Nguyen TS, Lalucque H & Silar P (2018) Identification and characterization of PDC1, a novel protein involved in the epigenetic cell degeneration Crippled Growth in Podospora anserinaMol. Microbiol. 110(4): 499-512.

84- Ferrari R, Lacaze I, Le Faouder P, Bertrand-Michel J, Oger C, Galano JM, Durand T, Moularat S, Chan Ho Tong L, Boucher C, Kilani J, Petit Y, Vanparis O, Trannoy C, Brun S, Lalucque H, Malagnac F & Silar (2018) Cyclooxygenases and lipoxygenases are used by the fungus Podospora anserina to repel nematodes. Biochimica & Biophysica Acta (BBA) – General Subjects 1862(10): 2174-2182.

83- Gautier V, Chan Ho Tong L, Nguyen TS, Debuchy R & Silar P (2018) PaPro1 and IDC4, two genes controlling stationary phase, sexual development and cell degeneration in Podospora anserinaJ. Fungi. 4(3): 85.

82- Xie N, Ruprich-Robert G, Silar P, Herbert E, Ferrari R & Chapeland-Leclerc F (2018) Characterization of three multicopper oxidases in the filamentous fungus Podospora anserina: A new role of ABR1-like in fungal development. Fung. Genet. Biol. 116: 1-13.

81- Silar P (2018) Epitypification of Malinvernia anserina revisited. Schlechtendalia 34: 1-2.

80- Cohen M, Lepesant G, Lamari F, Bilodeau C, Benyei P, Angles S, Bouillon J, Bourrand K, Landoulsi R, Jaboeuf D, Alonso-Roldan M, Espadas I, Belandria V, Silar P & Dicko M (2018) Biomolecules from olive pruning waste in Sierra Mágina – Engaging the energy transition by multi-actor and multidisciplinary analyses. J. Env. Manag. 216: 204-213.

2017

79- Boucher C., Nguyen TS & Silar P (2017) Species delimitation in the Podospora anserina/P. pauciseta/P. comata species complex (Sordariales). Cryptogamie Mycologie 38(4): 485-506.

78- Xie N, Ruprich-Robert G, Chapeland-Leclerc F, Coppin E, Lalucque H, Brun S, Debuchy R & Silar P (2017) Inositol-phosphate signaling as mediator for growth and sexual reproduction in Podospora anserinaDev. Biol. 429: 285-305.

77- Lalucque H, Malagnac F, Green K, Gautier V, Grognet P, Chan Ho Tong L, Scott B & Silar P (2017) IDC2 and IDC3, two genes involved in cell non-autonomous signaling of fruiting body development in the model fungus Podospora anserinaDev. Biol. 421: 126-138.

76- Green KA2, Becker Y, Tanaka A, Takemoto D, Fitzsimons HL, Seiler S, Lalucque H, Silar P & Scott B (2017) SymB and SymC, two membrane associated proteins, are required for Epichloë festucae hyphal cell-cell fusion and maintenance of a mutualistic interaction with Lolium perenneMol. Microbiol. 103: 657-677.

75- Tangthirasunun N, Navarro D, Garajova S, Chevret D, Chan Ho Tong L, Gautier V, Hyde KD, Silar P & Berrin JG (2017) Inactivation of Cellobiose Dehydrogenases Modifies the Cellulose Degradation Mechanism of Podospora anserinaAppl. Env. Microbiol. 83: e02716-16.

2016

74- Lacaze I, Moularat S, Bousta F, Draghi M, Silar P & Robine E (2016) Etude de la dynamique de colonisation microbienne de produits de construction. Matériaux et techniques 104: 507 1-13.

73- Jaber S, Mercier A, Knio K, Brun S & Kambris Z (2016) Isolation of fungi from dead arthropods and identification of a new mosquito natural pathogen. Parasites & Vectors 9(1): 491.

72- Timpano H, Chan Ho Tong L, Gautier V, Lalucque H & Silar P (2016) The PaPsr1 and PaWhi2 genes are members of the regulatory network that connect stationary phase to mycelium differentiation and reproduction in Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 94: 1-10.

71- Couturier M, Tangthirasunun N, Xie N, Brun S, Gautier V, Bennati-Granier C, Silar P, Berrin JG (2016) Plant biomass degrading ability of the coprophilic ascomycete fungus Podospora anserinaBiotechnology Advances 34: 976-983.

70- Wijayawardene NN, Hyde KD, Wanasinghe DN, Papizadeh M, Goonasekara ID, Camporesi E, Bhat DJ, McKenzie EHC, Phillips AJL, Diederich P, Tanaka K, Li WJ, Tangthirasunun N, Phookamsak R, Dai D-Q, Dissanayake AJ, Weerakoon G, Maharachchikumbura SSN, Hashimoto A, Matsumura M, Bahkali AH & Wang Y (2016) Taxonomy and phylogeny of dematiaceous coelomycetes. Fungal Diversity 77: 1-316.

2015

69- Tangthirasunun N, Silar P, Bhat DJ, Maharachchikumbura SSN, Wijayawardene NN, Bahkali AH & Hyde KD (2015) Morphology and phylogeny of two appendaged genera of coelomycetes: Ciliochorella and DiscosiaSydowia 66: 217-226.

68- Chapeland-Leclerc F, Dilmaghani A, Ez-Zaki L, Boisnard S, Da Silva B, Gaslonde T, Porée FH & Ruprich-Robert G (2015) Systematic gene deletion and functional characterization of histidine kinase phosphorelay receptors (HKRs) in the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatusFung. Genet. Biol. 84: 1-11.

67- Chan Ho Tong L, Dairou J, Bui LC, Bouillon J, Rodrigues-Lima F, Dupret JM & Silar P (2015) Screen for soil fungi highly resistant to dichloroaniline uncovers mostly Fusarium species. Fung. Genet. Biol. 81: 82-87.

66- Grognet P & Silar P (2015) Maintaining heterokaryosis in pseudo-homothallic fungi. Comm. Int. Biol. 8(4): e994382.

65- Lacaze I, Lalucque H, Siegmund U, Silar P & Brun S (2015) Identification of NoxD/Pro41 as the homologue of the p22phox NADPH oxidase subunit in fungi. Mol. Microbiol. 95: 1006-1024.

64- Goarin A, Silar P & Malagnac F (2015) Gene replacement in Penicillium roquefortiCurr. Genet. 61: 203-210.

63- Xie N, Ruprich-Robert G, Silar P & Chapeland-Leclerc F (2015) Bilirubin oxidase-like proteins from Podospora anserina: promising thermostable enzymes for application in transformation of plant biomass. Env. Microbiol. 17: 866-875.

2014

62- Tangthirasunun N, Silar P, Bhat DJ, Maharachchikumbura SSN & Hyde KD (2014) Greeneria saprophytica sp. nov. on dead leaves of Syzygium cumini from Chiang Rai, Thailand. Phytotaxa 184: 275-282.

61- Chan Ho Tong L, Silar P & Lalucque H (2014) Genetic control of anastomosis in Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 70: 94-103.

60- Tangthirasunun N, Silar P, Bhat DJ, Chukeatirote E, Wikee S, Maharachchikumbura SNM, Hyde KD & Wang Y (2014) Morphology and phylogeny of Chaetospermum (asexual coelomycetous Basidiomycota). Phytotaxa 175: 061-072.

59- Silar P (2014) Simple genetic tools to study fruiting body development in fungi. Open Mycol. 8: 148-155.

58- Tangthirasunun N, Silar P, Bhat DJ, Chukeatirote E, Wijayawardene DNN, Maharachchikumbura SSN & Hyde KD (2014) Morphology and phylogeny of Pseudorobillarda eucalypti sp. nov., from Thailand. Phytotaxa 176: 251-259.

57- Grognet P, Lalucque H, Malagnac F & Silar P (2014) Genes That Bias Mendelian Segregation. PLoS Genetics 10: e1004387.

56- Grognet P, Bidard F, Kuchly C, Chan Ho Tong L, Coppin E, Ait Benkhali J, Couloux A, Wincker P, Debuchy R & Silar P (2014) Maintaining two mating types: Structure of the mating type locus and its role in heterokaryosis in Podospora anserinaGenetics 197: 421-432.

55- Cheeseman K, Ropars J, Renault P, Dupont J, Gouzy J, Branca A, Abraham AL, Ceppi M, Conseiller E, Debuchy R, Malagnac F, Goarin A, Silar P, Lacoste S, Sallet A, Bensimon A, Giraud T & Brygoo Y (2014) Multiple recent horizontal transfers of a large genomic region in cheesemaking fungi. Nat. Comm. 5: 2876.

54- Xie N, Chapeland-Leclerc F, Silar P & Ruprich-Robert G (2014) Systematic gene deletions evidences that laccases are involved in several stages of wood degradation in the filamentous fungus Podospora anserinaEnv. Microbiol. 16: 141-161.

2013

53- Malagnac F, Fabret C, Prigent M, Rousset JP, Namy O & Silar P (2013) A Rab-GDI complex dissociation factor expressed through translational frameshifting in filamentous ascomycetes. PLoS ONE 8(9): e73772.

52- Ait Benkhali J, Coppin E, Brun S, Peraza-Reyes L, Martin T, Dixelius D, Lazar N, van Tilbeurgh H & Debuchy R (2013) A Network of HMG-Box Transcription Factors Regulates Sexual Cycle in the Fungus Podospora anserinaPLoS Genetics 7: e1003642.

51- Cocaign A, Bui L-H, Silar P, Chan Ho Tong L, Busi F, Lamouri A, Mougin C, Rodrigues-Lima F, Dupret JM & Dairou J (2013) Biotransformation and tolerance of Trichoderma spp. to aromatic amines, a major class of pollutants. Appl. Env. Microb. 79: 4719-4726.

2012

50- Morcx S, Kunz C, Choquer M, Assié S, Blondet, Simond-côte E, Gajek K, Chapeland-Leclerc F, Expert D & Soulié M-C. (2012) Disruption of Bcchs4, Bcchs6 or Bcchs7 chitin synthase genes in Botrytis cinerea and the essential role of classVI chitin synthase (Bcchs6). Fung. Genet. Biol. 52: 1-8.

49- Déquard-Chablat M, Nguyen T-T, Contamine V, Hermann-Le Denmat S & Malagnac F (2012) Efficient tools to target DNA to Podospora anserinaFung Gen. Rep. 59: 21-25.

48- Ropars J, Dupont J, Fontanillas E, Rodríguez de la Vega R, Malagnac F, Coton M, Giraud T & López-Villavicencio M (2012) Sex in cheese: evidence for sexuality in the fungus Penicillium roquefortiPLOS One 7(11): e49665.

47- Grognet P, Lalucque H & Silar P (2012) The PaAlr1 magnesium transporter is required for ascospore development in Podospora anserinaFung. Biol. 116: 1111-1118.

46- Bidard F, Coppin E & Silar P (2012) The transcriptional response to the inactivation of the PaMpk1 and PaMpk2 MAP kinase pathways in Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 49: 643–652.

45- Coppin E, Berteaux-Lecellier V, Bidard F, Brun S, Ruprich-Robert G, Espagne E, Aït-Benkhali J, Goarin A, Nesseir A, Planamente S, Debuchy R & Silar P (2012) Systematic deletion of homeobox genes in Podospora anserina uncovers their roles in shaping the fruiting body. PLoS ONE 7(5): e37488.

44- Lalucque H, Malagnac F, Brun S, Kicka S & Silar P (2012) A non-mendelian MAPK-generated hereditary unit controlled by a second MAPK pathway in Podospora anserinaGenetics 191: 419–433.

43- Lasrama S, Oueslati S, Mliki A, Ghorbel A, Silar P & Chebil S (2012) Ochratoxin A and ochratoxigenic black Aspergillus species in Tunisian grapes cultivated in different geographic areas. Food Control 25: 75-80.

42- Bourdais A, Bidard F, Zickler D, Berteaux-Lecellier V, Silar P & Espagne E (2012) Wood utilization is dependent on catalase activities in the filamentous fungus Podospora anserinaPLoS One 7(4): e29820.

2011

41- Bidard F, Aït Benkhali J, Coppin E, Imbeaud S, Grognet P, Delacroix H & Debuchy R (2011) Genome-wide gene expression profiling of fertilization competent mycelium in opposite mating types in the heterothallic fungus Podospora anserinaPLoS One 6(6): e21476.

40- Silar P (2011) Grafting as a mean to study development in the filamentous fungus Podospora anserinaFungal Biol. 115: 793-802.

39- Espagne E, Vasnier C, Storlazzi A, Kleckner N, Silar P, Zickler D & Malagnac F (2011) Sme4 coiled-coil protein mediates synaptonemal complex assembly, recombinosome relocalization and spindle pole body morphogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 26: 10614-10619.

2010

38- Martins M, Dairou J, Rodrigues-Lima F, Dupret JM & Silar P (2010) Insights into the phylogeny or arylamine N-acetyltransferases in fungi. J. Mol. Evol. 71: 141–152.

37- Grissa I, Bidard F, Grognet P, Grossetete S & Silar P (2010) The Nox/Ferric reductase/Ferric reductase-like families of Eumycetes. Fungal Biol. 114: 766-777.

36- Bidard F, Imbeaud S, Reymond N, Lespinet O, Silar P, Clave C, Delacroix H, Berteaux-Lecellier V & Debuchy R (2010) A general framework for optimization of probes for gene expression microarray and its application to the fungus Podospora anserinaBMC Res Notes 3: 171.

2009

35- Brun S, Malagnac F, Bidard F, Lalucque H & Silar P (2009) Functions and regulation of the Nox family in the filamentous fungus Podospora anserina: a new role in cellulose degradation. Mol. Microbiol. 74: 480-496.

34- Martins M, Rodrigues-Lima F, Dairou J, Lamouri A, Malagnac F, Silar P & Dupret JM (2009) An acetyltransferase conferring tolerance to toxic aromatic amine chemicals: molecular and functional studies. J. Biol. Chem. 284: 18726-18733.

2008

33- Malagnac F, Bidard F, Lalucque H, Brun S, Lambou K, Lebrun MH & Silar P (2008) Convergent evolution of morphogenetic processes in fungi: Role of tetraspanins and NADPH oxidases 2 in plant pathogens and saprobes. Communicative & Integrative Biology 1:180-181.

32- Lambou K, Malagnac F, Barbisan C, Tharreau D, Lebrun MH & Silar P (2008) The crucial role during ascospore germination of the Pls1 tetraspanin in Podospora anserina provides an example of the convergent evolution of morphogenetic processes in fungal plant pathogens and saprobes. Euk. Cell 7: 1809-1818.

31- Espagne E$, Lespinet O$, Malagnac F$, Da Silva C, Jaillon O, Porcel BM, Couloux A, Aury J.M, Ségurens B, Poulain J, Anthouard V, Grossetete S, Khalili H, Coppin E, Déquard-Chablat M, Picard M, Contamine V, Arnaise S, Bourdais A, Berteaux-Lecellier V, Gautheret D, de Vries RP, Battaglia E, Coutinho PM, Danchin EGJ, Henrissat B, El Khoury R, Sainsard-Chanet A, Boivin A, Pinan-Lucarré B, Sellem C.H, Debuchy R, Wincker P, Weissenbach J & Silar P (2008) The Genome Sequence of the Model Ascomycete Fungus Podospora anserinaGenome Biology 9: R77. $ These authors contributed equally to the work

2007

30- Malagnac M, Klapholz B & Silar P (2007) PaTrx1 and PaTrx3, two cytosolic thioredoxins of the filamentous ascomycete Podospora anserina involved in sexual development and cell degeneration. Euk. Cell 6: 2323-2331.

29- Jamet-Vierny C, Debuchy R, Prigent M & Silar P (2007) IDC1, a Pezizomycotina-specific gene that belongs to the PaMpk1 MAP kinase transduction cascade of the filamentous fungus Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 44: 1219-1230.

28- Coppin E & Silar P (2007) Identification of PaPKS1, a polyketide synthase involved in melanin formation and its utilization as a genetic tool in Podospora anserinaMycol. Res. 111: 901-908.

2006

27- Dequard-Chablat M & Silar P (2006) Podospora anserina AS6 gene encodes the cytosolic ribosomal protein of the E. coli S12 family. Fung. Genet. Newslett. 53: 26-29.

26- Malagnac F & Silar P (2006) Regulation, cell differentiation and protein-based inheritance. Cell Cycle 5: 2584 – 2587.

25- Kicka S, Bonnet C, Sobering AK, Ganesan LP & Silar P (2006) A mitotically inheritable unit containing a MAP kinase module. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 36: 13445-13450.

2005

24- Haedens V, Malagnac F & Silar P (2005) Genetic control of an epigenetic cell degeneration syndrome in Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 42: 564-577.

23- Silar P (2005) Peroxide accumulation and cell death in filamentous fungi induced by contact with a contestant. Mycol. Res. 109: 137-149.

2004

22- Malagnac F, Lalucque H, Lepère G & Silar P (2004) Two NADPH oxidase isoforms are required for sexual reproduction and ascospore germination in the filamentous fungus Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 41: 982-997.

21- Graziani S, Silar P & Daboussi MJ (2004) Bistability and hysteresis of the “Secteur” differentiation is controlled by a two-gene locus in Nectria haematococcaBMC Biology 2:18.

20- Kicka S & Silar P (2004) PaASK1, a MAPKKK that controls cell degeneration and cell differentiation in Podospora anserinaGenetics 166: 1241-1252.

19- Lalucque H & Silar P (2004) Incomplete penetrance and variable expressivity of a growth defect as a consequence of knocking out two K+ transporters in the euascomycete fungus Podospora anserinaGenetics 166: 125-134.

2003

18- Malagnac F & Silar P (2003) Non-Mendelian determinants of morphology in fungi. Curr. Op. Microbiol. 6: 641-645.

17- Silar P, Barreau C, Debuchy R, Kicka S, Turcq B, Sainsard-Chanet A, Sellem CH, Billault A, Cattolico L, Duprat S & Weissenbach J (2003) Characterization of the genomic organization of the region bordering the centromere of chromosome V of Podospora anserina by direct sequencing. Fung. Genet. Biol. 39: 250-263.

16- Lalucque H & Silar P (2003) NADPH oxidases : an enzyme for multicellularity? Trends Microbiol. 11: 9-12.

2002

15- Barreau C, Sellem C, Silar P, Sainsard-Chanet A & Turcq B (2002) A rapid and efficient method using chromoslots to assign any newly cloned DNA sequence to its cognate chromosome in the filamentous fungus Podospora anserinaFEMS Microbiol. Lett. 216: 55-60.

2001

14- Silar P, Lalucque H, Haedens V, Zickler D & Picard M (2001) eEF1A controls ascospore differentiation through elevated accuracy, but controls longevity and fruiting body formation through another mechanism in Podospora anserinaGenetics 158: 1477–1489.

13- Silar P, Lalucque H & Vierny C (2001) Cell degeneration in the model system Podospora anserinaBiogerontology 2: 1-17.

2000

12- Lalucque H & Silar P (2000) In vivo labelling of functional ribosomes reveals spatial regulation during starvation in Podospora anserinaBMC Genetics 1: 3.

11- Silar P, Rossignol M, Tahar R, Derhy Z & Mazabraud M (2000) Informational suppressor alleles of eEF1A gene, fertility & cell degeneration in Podospora anserinaMol. Gen. Genet. 264: 354-362.

10- Silar P, Rossignol M, Haedens V, Derhy Z & Mazabraud A (2000) Deletion & dosage modulation of the eEF1A gene in Podospora anserina: effect on the life cycle. Biogerontology 1: 47-54.

1999

9- Jamet-Vierny C, Rossignol M, Haedens V & Silar P (1999) What triggers Senescence in Podospora anserinaFung. Genet. Biol. 27: 26-35.

8- Silar P & Daboussi MJ (1999) Non-conventional infectious elements in filamentous fungi. Trends Genet. 15: 141-145.

7- Silar P, Haedens V, Rossignol M & Lalucque H (1999) Propagation of a novel cytoplasmic, infectious and deleterious determinant is controlled by translational accuracy in Podospora anserinaGenetics 151: 87-95.

1998

6- Gagny B & Silar P (1998) Identification of the genes encoding the cytosolic translation release factors from Podospora anserina and analysis of their role during the life cycle. Genetics 149: 1763-1765.

1997

5- Jamet-Vierny C, Contamine V, Boulay J, Zickler D & Picard M (1997) Mutations in genes encoding the mitochondrial outer membrane proteins Tom70 and Mdm10 of Podospora anserina modify the spectrum of mitochondrial DNA rearrangements associated with cellular death. Mol. Cell. Biol. 17: 6359-6366.

4- Gagny B, Rossignol M & Silar P (1997) Cloning, sequencing and transgenic expression of Podospora curvicolla and Sordaria macrospora eEF1A genes: relationship between cytosolic translation and longevity in filamentous fungi. Fung. Genet. Biol. 22: 191-198.

3- Silar P, Koll F & Rossignol M (1997) Cytosolic ribosomal mutations that abolish amplification of circular intron without preventing senescence in Podospora anserinaGenetics 145: 697:705.

2- Jamet-Vierny C, Boulay J, Begel O & Silar P (1997) Contribution of various classes of defective mitochondrial DNA molecules to senescence in Podospora anserinaCurr. Genet. 31: 171-178.

1- Jamet-Vierny C, Boulay J & Briand JF (1997) Intramolecular cross-overs generate deleted mitochondrial DNA molecules in Podospora anserinaCurr. Genet. 31: 162-170.

Livres

2020

5- Philippe Silar (2020) Génétique : Concepts de Base et Notions Approfondies. En accès libre (https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02921475) ISBN 978-2-9555841-3-2

4- Philippe Silar (2020) Podospora anserina. En accès libre (https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02475488) ISBN n°978-2-9555841-2-5

2016

3- Philippe Silar (2016) Bases Fondamentales de la Biologie. En accès libre (https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01401263) ISBN n°978-2-9555841-1-8

2- Philippe Silar (2016) Protistes Eucaryotes : Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes. En accès libre (https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01263138) ISBN n°978-2-9555841-0-1

2013

1- Philippe Silar & Fabienne Malagnac (2013) Les champignons redécouverts. Ed. Belin. ISBN n°978-2701159027

Chapitres de livre

2022

11- Silar P (2022) Prions and Prion-like Phenomena in Epigenetic Inheritance. In Handbook of Epigenetics: The New Molecular and Medical Genetics (3rd edition). Trygve Tollefsbol ed., pp 73-87.

2021

10- Ferrari R, Gautier V & Silar P (2021) Lignin degradation by ascomycetes. In Advances in Botanical Research 99: 77-113.

2019

9- Silar P (2019) Phenotypic instability in fungi. In Adv. Appl. Microbiol. 107: 141-187.

2017

8- Nguyen TS, Lalucque H, Malagnac F & Silar P (2017) Prions and Prion-like Phenomena in Epigenetic Inheritance. In Handbook of Epigenetics (2nd edition). Trygve Tollefsbol ed., pp. 61-72.

2013

7- Silar P (2013) Podospora anserina: from laboratory to biotechnology. In Genomics of Soil- and Plant-Associated Fungi. Benjamin Horwitz et al., eds. pp 283-309.

2012

6- Silar P (2012) Hyphal Interference: self versus non-self fungal recognition and hyphal death. In Biocommunication of Fungi. Günther Witzany ed. pp 155-170.

2011

5- Cocaign A, Dairou J, Busi F, Silar P, Martins M, Mougin C, Rodrigues-Lima F & Dupret JM (2011) Pesticide-Derived Armatic Amines and Their Biotransformation. In Pesticide in the Modern World. Margarita Stoytcheva ed. pp 601-614.

2010

4- Malagnac F & Silar P (2010) Epigenetics of Eukaryotic Microbes. In Handbook of Epigenetics. Trygve Tollefsbol ed. pp. 185-201.

3- Lalucque H, Malagnac F & Silar P (2010) Prions and Prion-like Phenomena in Epigenetic Inheritance. In Handbook of Epigenetics. Trygve Tollefsbol ed. pp. 63-76.

2- Brun S & Silar P (2010) Convergent evolution of morphogenetic processes in fungi. In Evolutionary Biology – Concepts, Molecular and Morphological Evolution. pp. 317-328.

1- Debuchy R, Berteaux-Lecellier V & Silar P (2010) Mating Systems and Sexual Morphogenesis in Ascomycetes. In Cellular and Molecular Biology of Filamentous Fungi. K. Borkovich and D. Ebbole eds. pp. 501-535.

Autres

7- Silar P (2020) À la découverte des microbes – I : un aperçu de leur classification. Bulletin de la Société linnéenne Nord-Picardie 38 : 3-7.

6- Silar P (2013) La mycologie au début du 21 siècle : crise et renouveau. Biol. Auj. 207: 1-7.

5- Pereira C, Azé J, Denise A, Drevet C, Froidevaux C, Silar P & Lespinet O (2013) Comparative analysis of phylogenetic profiles for the enzymatic characterization of fungal groups. JOBIM, editors: Christine Gaspin, Nic Lindley and Cédric Notredame, pages 269-279.

4- Cocaign A, Dairou J, Rodrigues-Lima F, Silar P & Dupret JM (2012) Biotransformation of aromatic amines in contaminated soils: characterization of fungal acetyltransferases. FEBS J. 279(SI1): 438.

3- Silar P, Dairou J, Cocaign A, Busi F, Rodrigues-Lima F & Dupret JM (2011) Fungi as a promising tool for bioremediation of soils contaminated with aromatic amines, a major class of pollutants. Nat. Rev. Microbiol. 9: 477.

2- Martins M, Silar P, Dairou J, Malagnac F, Rodrigues-Lima F & Dupret JM (2007) Cloning, and functional characterization of two NAT enzymes in the soil fungus Podospora anserinaFEBS J. 274: 226.

1- Silar P, Vierny C, Gagny B, Rossignol M & Haedens V (1997) Génétique de deux dégénérescences cellulaires chez le champignon filamenteux Podospora anserina. C. R. Soc. Biol. 191: 563-577.

Autres publications des membres du laboratoire en collaboration externe

12- Planchon M, Léger T, Spalla O, Huber G & Ferrari R (2017) Metabolomic and proteomic investigations of impacts of titanium dioxide nanoparticles on Escherichia coliPLOS One 12(6): e0178437.

11- Huang SK, Tangthirasunun N, Phillipps AJL, Dai, DQ, Wanasinghe DN, Wen, TC, Bahkali AH, Hyde KD & Kang JC (2016) Morphology and Phylogeny of Neoscytalidium orchidacearum sp. nov. (Botryosphaeriaceae). Mycobiology 44: 79-84.

10 -Abdallah J, Mihoub M, Gautier V & Richarme G (2016) The DJ-1 superfamily members YhbO and YajL from Escherichia coli repair proteins from glycation by methylglyoxal and glyoxal. Biochem Biophys Res Commun 470(2): 282-286.

9- Samazan F, Rokbi B, Seguin D, Telles F, Gautier V, Richarme G, Chevret D, Varela PF, Velours C & Poquet I (2015) Production, secretion and purification of a correctly folded staphylococcal antigen in Lactococcus lactisMicrob Cell Fact. 14: 104.

8- Messaoudi N, Gautier V, Dairou J, Mihoub M, Lelandais G, Bouloc P, Landoulsi A & Richarme G (2015) Fermentation and Alternative Respiration Compensate for NADH Dehydrogenase Deficiency in a Prokaryotic Model of DJ-1 Associated Parkinsonism. Microbiology 161: 2220-2231

7- Gelabert A, Gobbi P, Sivry Yann M, Nina, Brayner R, Siron V, BenedettiM & Ferrari R (2015) Testing Nano effect onto model bacteria: impact of speciation and genotypes. Nanotoxicology 23: 1-10.

6- Song Y, Tangthirasunun N, Maharachchikumbura SSN, Jiang Y, Xu J, Hyde KD & Wang Y (2014) Novel Pestalotiopsis Species from Thailand Point to the Rich Undiscovered Diversity of this Chemically Creative Genus. Cryptogamie, Mycologie 25: 139-149.

5- Ruprich-Robert G, Wery M, Després D, Boulard Y & Thuriaux P (2011) Crucial role of a dicarboxylic motif in the catalytic center of yeast RNA polymerases. Curr Genet. 57: 327-34.

4- Chapeland-Leclerc F, Hennequin C, Papon N, Noël T, Girard A, Socié G, Ribaud P & Lacroix C (2010) Acquisition of flucytosine, azole, and caspofungin resistance in Candida glabrata bloodstream isolates serially obtained from a hematopoietic stem cell transplant recipient. Antimicrob Agents Chemother. 54: 1360-2.

3- Ruprich-Robert G, Thuriaux P (2010) Non-canonical DNA transcription enzymes and the conservation of two-barrel RNA polymerases. Nucleic Acids Res. 38: 4559-4569.

2- Storlazzi A, Gargano S, Ruprich-Robert G, Falque M, David M, Kleckner N & Zickler D (2010) Recombination proteins mediate meiotic spatial chromosome organization and pairing. Cell 141: 94-106.

1- Padilla-Parra S, Audugé N, Lalucque H, Mevel JC, Coppey-Moisan M & Tramier M. (2009) Quantitative comparison of different fluorescent protein couples for fast FRET-FLIM acquisition. Biophys J. 97: 2368-2376.

Thèses du laboratoire

  • Thèse de Hervé Lalucque mars 2002 Université de Paris Sud “ETUDES DE DÉGÉNÉRESCENCES CELLULAIRES CAUSÉES PAR DES ÉLÉMENTS NON-CONVENTIONNELS INFECTIEUX DANS LE CHAMPIGNON FILAMENTEUX PODOSPORA ANSERINA”
  • Thèse de Stéphane Graziani juin 2002 Université de Paris Sud “CARACTÉRISATION DE GÈNES IMPLIQUÉS DANS LE DÉTERMINISME DE DEUX MODIFICATIONS CONTAGIEUSES CHEZ NECTRIA HAEMATOCOCCA”
  • Thèse de Sébastien Kicka février 2005 Université de Paris 7 Denis Diderot “CONTRIBUTION À L’ÉTUDE DE L’ALTÉRATION CRIPPLED GROWTH CHEZ LE CHAMPIGNON FILAMENTEUX PODOSPORA ANSERINA : IMPLICATION DE VOIES DE SIGNALISATION MAP KINASES”
  • Thèse de Anne Goarin Novembre 2011 Université de Paris 7 Denis Diderot “ETUDE DE LA VARIABILITE PHENOTYPIQUE CHEZ UNE SOUCHE INDUSTRIELLE DE PENICILLIUM ROQUEFORTI”
  • Thèse de Pierre Grognet Septembre 2013 Université de Paris 7 Denis Diderot “CONTRIBUTIONS A L’ETUDE DES DEGENERESCENCES DU MYCELIUM ET DES SPORES CHEZ LE CHAMPIGNON FILAMENTEUX PODOSPORA ANSERINA”
  • Thèse de Ning Xie Avril 2014 Université de Paris 7 Denis Diderot “CARACTERISATION FONCTIONNELLE DES GENES DE LACCASES ET DE BILIRUBINE OXYDASES, APPARTENANT A LA FAMILLE DES GENES MULTICOPPER OXYDASES, CHEZ LE CHAMPIGNON COPROPHILE PODOSPORA ANSERINA : VERS UNE MEILLEURE COMPREHENSION DE LA DEGRADATION DE LA LIGNOCELLULOSE PAR LES CHAMPIGNONS”
  • Thèse de Narumon Tangthirasunun Juin 2014 Université de Paris 7 Denis Diderot “CHAMPIGNON SAPROTROPHES: DIVERSITE DES COELOMYCETES DE THAÏLANDE ET GENES IMPLIQUES DANS LA DEGRADATION DE LA BIOMASSE CHEZ PODOSPORA ANSERINA”
  • Thèse de Isabelle Lacaze Mai 2016 Université de Paris 7 Denis Diderot “ETUDE DES MECANISMES DE COLONISATION DES PRODUITS DE CONSTRUCTION PAR LES MICROMYCETES”
  • Thèse de Tinh-Suong Nguyen Septembre 2018 Université de Paris 7 Denis Diderot “ETUDE DE LA DEGENERESCENCE CELLULAIRE EPIGENETIQUE CRIPPLED GROWTH CHEZ LE CHAMPIGNON PODOSPORA ANSERINA”
  • Thèse de Alexander Demoor février 2021 Université de Paris “ETUDE DES GENES ET DES PROCESSUS CELLULAIRES IMPLIQUES DANS LA GERMINATION DES ASCOSPORES ET LA FORMATION DE L’APPRESSORIUM CHEZ PODOSPORA ANSERINA”